1946年,二战结束,莱佛士学院重新开课,委任W E Dyer 为院长 马来亚大学 马来亚大学1940年,在英国驻东南亚最高专员麦唐纳 (Malcolm MacDonald)的倡议下,英国政府通过了《殖民地发展与福利法案》(Colonial Development and Welfare Bill),支持各殖民地加速推展发展项目。
1947年,以伦敦政治经济学院院长卡尔桑德斯爵士(Sir Alexander Carr-Saunders)领导的委员会,着手研究在新加坡兴办大学的可行性。1948年,《卡尔桑德斯委员会报告书》(Carr-Saunders Commission Report)发表,建议创办可颁授学士学位的全方位综合大学。
1949年,马来亚大学成立,由英国驻东南亚最高专员麦唐纳出任名誉校长,爱德华七世医学院院长乔治艾伦(G V Allen)博士担任校长。马来亚大学理事陈振传出资制作大学权杖,由英国银器珠宝商Mappin和Webb先生设计。1953年,图书馆新大楼竣工落成。马来亚联邦政府与新加坡殖民地政府成立联合委员会,检讨马大医科教育的未来发展。
马来亚大学协会(University of Malaya Society)成立,以更好地代表和推动马大毕业生权益。1957年,伯明翰大学校长R S Aitken受委领导一支五人咨询委员会,对马来亚大学的组织结构、行政、财务与扩展进行全面检讨。马来亚大学在吉隆坡开课,筹备在马来亚联邦成立马来亚大学吉隆坡分校。
1959年,马来亚大学新章程生效,马来亚大学更名为“新加坡马来亚大学”(University of Malaya in Singapore)。印度学系、马来研究系、地理系及工程系迁至马来亚大学吉隆坡分校。1961年,“新加坡大学条例”(University of Singapore Ordinance) 取代“马来亚大学条例”(University of Malaya Ordinance)。